Toolbox opties kunnen niet verwijderd worden, omdat dit invloed zou hebben op de reeds ingestuurde toolboxen. Wel kunnen toolbox opties inactief gemaakt worden. Inactieve toolbox opties worden niet meer opgenomen bij de toolbox voor nieuw TOP dossier.
Let op, de toolbox opties worden bij een TOP dossier ingeladen op het moment dat de toolbox voor het eerst wordt geopend. Het kan dus zijn, als de school de toolbox al een keer geopend had maar nog niet heeft verzonden, dat een inactief gemaakte toolbox optie later nog binnenkomt.